到底兩台飛機是怎麼擦撞的？長榮表示，當時航機依塔台指示在L14「滑行道」停止等待的時候，泰國航空一架班機從後方靠近要轉彎時，機翼尖「小翼」，擦撞長榮航機後方左側「水平尾翼」，目前日本的國土交通省初步研判，是泰航的疏失。
前機師分析根據先前的飛行經驗，日本機場跑道複雜，如果機鼻沒對準中線很容易就會跑錯，而撞擊之後，泰航的翼尖小翼少一小截，長榮水平尾翼受損，碎片散落一地，消防車及救護車陸續到場，羽田機場4個跑道中，其中A跑道緊急關閉將近2小時，部分國內國際航班都受延誤。
前機師張志豪：「其實羽田跟成田(機場)都特別複雜，尤其在某個部分的滑行道，根據我過去飛行的經驗，羽田的滑行道是非常難滑的，而且某些區域是非常錯綜複雜。」
從旅客下機時拍攝的泰國航空飛機，泰航客機翼尖直接掉了一塊，長榮的水平尾翼也受損，機師分析如果是在空中碰撞，飛機可能會有翻轉解體的風險，在地面的話沒修好絕對不能飛。
前民航機師于晧瑋：「他們都是聽塔台指示，但是如果這兩架飛機，都這麼靠近的狀況下，而且長榮是絕對，我個人認為是百分百沒有錯，因為是塔台叫它停下來，它就會停下來。」
因為飛機要停要動都得聽塔台，飛行員有疏失但塔台也得負點責任，後續經過鑑定報告，如果是因為泰航飛機直接撞上，長榮可以請求賠償，而調查經過三方都能介入。
前機師張志豪：「它是屬於屬地主義，發生在日本就會由日本民航局，飛航安全的單位做調查，但是不管是泰國還是台灣，應該都可以請求一起調查，或是到現場去看調查情況權力。」
由於事發當下都得調查釐清，第一時間機上乘客都不能下飛機，而維修費用粗估也得花上幾百萬跑不掉。
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