台灣確診兒童併發腦炎的個案不少，比例比國外要高，而現在醫界擔心小朋友的後遺症問題，台大醫院和長庚醫院曾針對腸病毒71型的重症病童，做多年的追蹤研究，發現活下來的小孩，不少有發育的異常，像是「類小兒麻痺症候群」等狀況，TVBS獨家採訪到當年做研究的張鑾英醫生，從腸病毒71型的經驗來看現在的新冠肺炎。
小朋友身上有著氣切管和呼吸器，還加上鼻胃管，讓人看了很心痛，這些孩童因為腸病毒71型侵犯到腦幹，運動神經元受損，影響到吞嚥和呼吸，有些人需要好幾年的時間才能把氣切管拿掉，照片中另一個小朋友，左側肩膀無力萎縮，有時候左肩關節會半脫臼或脫臼，神經元破壞損傷，留下永久後遺症，是左側類小兒麻痺症候群。
台大醫院小兒部副主任張鑾英：「我們發現說，如果是腦炎、腦膜炎，沒有到休克的小朋友，大部分他們的生長發育是沒有大問題，最嚴重的後遺症，發生在就是腦幹炎，有心肺衰竭的小孩子，那這些小孩子大概有四分之三，他們都有一些發展或是發育的異常，類小兒麻痺症候群看輕微或是嚴重，(比較嚴重的)他如果一年之後，沒有恢復，大部分就會是有永久的後遺症，那可能他就是手或是腳就無力，那有些就是需要就是使用支架。」
台大醫院小兒部副主任張鑾英：「我們有在做延續性的研究，大概就是在2020，就是他們已經發病了10幾年以後，(發現)他們注意力不集中的情況還是有的。」
而現在新冠肺炎確診兒童越來越多，重症比例也不低，台大醫院之後將開設兒童康復者的整合門診，根據張鑾英醫師觀察，新冠腦炎的小孩，在ICU拔管以後沒有吞嚥和呼吸的問題，但是。
台大醫院小兒部副主任張鑾英：「有一個(確診)小孩子是一歲多，他本來是會走會跑，(拔管後)但是他現在是恢復到說可以坐，就是7、8個月小孩子的那個神經功能，那可能要經過一段時間，看看他是不是可以回到原來，原本的那個智能發展，其實我目前看起來，腸病毒71型後遺症比新冠後遺症嚴重。」
兒童新冠後遺症還需要時間追蹤，而不管是成人還是小孩，新冠病毒對人類的影響還很難說，在康復以後，需要政府投入心力和資源來協助，中研院院士陳培哲提醒要從兩方向著手。
中研院院士陳培哲：「LongCOVID可能要去區分，到底哪些是真的是疾病相關的，那哪些是因為我們社會管制措施造成的，(後遺症追蹤)它是包括生物學，就是疾病方面的問題，還有一個是心理的因素，這兩個可能綜合起來，才可以解釋這個現象，但是所以它的研究，可能要兩個方向去處理。」
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