雖然很多人還沒接種第二劑疫苗，但現在指揮中心已經率先規劃第三劑施打方案，專家也建議第一波對象應該以1到3類高風險族群優先，指揮官陳時中則表示，第三劑頃向以同廠牌施打，將在11月底由ACIP委員討論第三針詳細規劃。
第三劑疫苗最快明年一月開打，指揮中心規劃要打同廠牌，但細節要等11月底才開會討論，目前只能確定，我們手上會有兩千萬劑莫德納疫苗，提供給第三劑。
指揮中心發言人莊人祥：「目前已經確定的是，跟莫德納疫苗這邊也購買了2千萬劑的，第三劑或次世代疫苗。」
能早點打當然是好事，但也要看到時候，國內整體疫苗數量，指揮中心初步統計，明年1月底前，大約有26.3萬人打完第2劑後，間隔6個月以上，至於第三劑想怎麼打，民眾有不同看法。
民眾：「當下再判斷，沒有特別說一定要打哪一種。」
民眾：「可能考慮混打，因為剛好他們最近有說可以開放混打，想說如果政府都這樣說的話，應該是也不錯。」
傳染病防治諮詢會預防接種組委員邱政洵：「你只要後面第三劑使用的，確實是它有通過EUA，可以用來做第三劑的就可以。」
另外醫師黃立民也指出，其實因為已經隔6個月了，所以像是AZ疫苗加莫德納疫苗，混打後再加BNT疫苗，打3種不同疫苗也可以，指揮中心11月底，將交由ACIP委員討論，另外還沒取得國際認證的高端疫苗，現在似乎露出一線曙光。
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