印度Delta變種病毒在全球蔓延，導致英國、美國和許多東南亞國家紛紛淪陷，另外還有南非、巴西、英國等變種病毒株，不僅傳染力更強，就連現有的疫苗也不足以抵擋，有專家建議，在Delta病毒尚未在台灣造成災情前，不妨考慮入境普篩，另外居家檢疫期滿也最好強制篩檢，至少多重防護、多份保障，不過防疫指揮官陳時中認為，目前的居家檢疫14天已經很足夠，台灣邊境算是有守住了。
不只印度Delta、英國Alpha，現在俄羅斯還有莫斯科變種病毒，祕魯也出現變異株Lambda，在拉丁美洲29個國家肆虐，傳染更快、抗藥力頑強。有醫師建議，既然PCR檢測能量增加，國門不妨入境普篩，居家檢疫期滿，採檢陰性再解除隔離，民眾才能多份保障。
精神科醫師潘建志：「因為現在東南亞其實Delta是肆虐得很厲害，新加坡也是被Delta搞得人心惶惶這樣子，那印尼也很多有可能東南亞的就會，把這個Delta帶進來。」
防疫指揮官陳時中：「入境普篩事實上對這個病毒的防治，並沒有特別的效果，那查完是陰性他也是要隔離起來，那陽性當然及早送到醫院去，邊境這樣的一個方式，算是我們有把這個邊境有把它守得住。」
死守邊境有成效，防疫指揮中心沿用去年作法，但變種病毒戰力升級，台灣鄰國防線已被一一擊破，篩檢最嚴格的大陸，5月21日出現Delta病毒後，火速採檢1800萬人，把傳播鏈控制在廣州，澳洲墨爾本則靠徹底封城壓制，至於日本、韓國、菲律賓、越南，都是一波未平一波又起，更別說疫苗接種名列前茅的英國、美國，7月極可能疫情再爆發。
前陽明大學微生物免疫研究所教授張南驥：「每個地方都有(變種病毒)，只是它是不是可以被世界公認，它是不是可以取代別的，更厲害的變種病毒，在某個區域廣為流傳流行才知道啊，自然法則中間已經被選出來是最優秀的，第一個它是容易進去(人體細胞)，第二個是它生產過程很快，產生的子代很多。」
精神科醫師潘建志：「我看過有一些報告，因為我們現在有很多檢測器材，我說你們PCR它都是取病毒的一段RNA，有一些病毒變種到已經，跟一段我們拿來測的那段核酸不一樣，居然有這種變種。」
變種病毒防不勝防，精神科醫師潘建志警告，台灣就算沒有外來的印度變種，都可能就地演化、出現Delta變異株，台北市長柯文哲憂心忡忡。
台北市長柯文哲(2021.6.16)：「新冠肺炎的病毒那個突變速度這麼快，這不是疫苗打第三劑的問題，是要打不同疫苗的問題。」
免疫學權威張南驥拿出實證圖表，打過兩劑輝瑞疫苗的血清抗體，經過8周和16周後，對變種病毒的效力明顯下降，AZ疫苗效果更差。台灣缺乏武器對抗變種病毒，只能祈禱邊境防守沒有漏網之魚。
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