新北市有洗腎診所反映，因為不是疫苗簽約診所，開封後多的疫苗，不能幫其他1至7類人接種，只能繳回時效過了就丟棄，認為很浪費，對此新北市衛生局回應，診所可以把剩餘疫苗提供給院內人員和造冊病人，而北市也有類似狀況，柯文哲說明，醫療院所可以彈性使用，健康服務中心則建議，開封前可以找齊符合資個的人再施打。
洗腎患者躺在病床上，由診所醫護人員幫忙施打疫苗，但一瓶疫苗能打10個人，每間洗腎中心接種人數，不會剛剛好全用完，偏偏洗腎中心不是疫苗簽約診所，不能讓其他1至7類公費對象接種，因此開封的疫苗只能繳回，時效過了就丟棄。
洗腎診所院長曾常新：「能夠多打一個人，就能多救一條命，越多人施打總體免疫會提升，對我們防疫更有幫助。」
疫苗得來不易卻不能完全用完，讓院方認為很可惜，以病人25人來計算，就會配發到3瓶疫苗，是打30人的量一定會有剩，對此新北市衛生局解釋，非疫苗簽約洗腎診所要是有剩餘疫苗，可以提供給院內人員或是造冊病人使用，但類似狀況不只發生在新北。
記者張蕙纖：「北市府宣布，開封過後剩餘的疫苗，(疫苗簽約)診所都能夠，拿來自行運用，不過在士林區有洗腎診所說，他們因為沒收到公文，因此剩餘的疫苗，不能拿來給符合資格的人，只能丟掉很浪費。」
一名醫護人員爆料，因為他們不是疫苗簽約診所，需要先造冊給北市衛生局再領取疫苗，但有部分病患臨時不願施打，導致疫苗剩下，結果打給健康服務中心，卻說因為沒公文，所以不能幫其他有資格對象施打。
台北市長柯文哲：「打了6人剩下4人怎麼辦，難道把4人份丟掉，不必要啊，我相信大家會把手上資源，做最合理分配。」
柯文哲認為，各醫療院所能有彈性作法避免疫苗浪費，也強調一定有寄公文告知診所，而健康服務中心則建議，非疫苗簽約洗腎診所，除了幫院內人員或是造冊病人施打，疫苗開封前，也應該找其他符合資格接種對象，先湊齊人數再施打，避免浪費。
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