今年媽祖遶境卡在新冠肺炎，要辦不辦引發論戰，知名網路作家藤井樹在臉書發文，寫下「遶境這件事，明顯顏清標大於媽祖」，表達對大甲媽照常遶境的不滿，中台灣教授協會甚至發起連署暫停遶境活動，已經有1千多人參與，但雲林縣長張麗善就表示支持，遶境引爆論戰，不過也有學者指出，網路上不理智謾罵，只會造成社會恐慌。
劈頭第一句，遶境這件事，明顯顏清標大於媽祖。藤井樹提到台灣防疫工作將近一個月來的努力，不敢說肯定會因為遶境而崩盤，但風險肯定高很多，所有為防疫努力的單位若因此崩盤的代價，在顏清標眼裡，應該是不如一尊媽祖像的重吧，最後還寫下人要找死，神也難救，說重話表達不滿。
不只他，中台灣教授協會更發起連署書，呼籲暫停大甲遶境活動和其他大型宗教活動，目前已經累積1千多人連署。
立委(基進)陳柏惟：「我們呼籲廟方主動來停辦活動，不要把責任丟到政府身上。」
遶不遶境爆發唇槍舌戰，連帶政治大老們收到鎮瀾宮邀請函都得要想一想。
前總統馬英九(2007)：「從那邊走過來是騰雲駕霧啊。」
2007年馬英九剛卸任國民黨黨主席來扶媽祖神轎，隔年就順利當選總統，還因此讓大甲媽起轎和當選總統劃上等號，但今年馬英九受邀，表示一切配合主辦單位規劃和疫情中心的決策，但也有人支持廟方決定。
雲林縣長張麗善：「我尊重媽祖的決定，也尊重所有的這個信徒的信仰。」
中研院人社中心博士洪瑩發：「這樣複雜的情事或者是網路的輿論，拉高之後造成的社會恐慌，很多人是就觀光的心態去(批評)，他忘記了有一群核心的信徒，他是因為宗教因素，他是跟媽祖是有一個承諾的。」
學者補充，最好還是中央統一下令，讓媽祖遶境爭議從複雜簡單化。
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