秋行軍蟲全台肆虐，目前僅南投、嘉義未淪陷，農委會坦言，要根治滅絕幾乎不可能，要有與蟲共存的打算。而且目前發現的通報案例專吃玉米，外界憂心全台每年約11萬公噸的玉米產量，可能受到衝擊。
記者李頂立：「在我旁邊，比我個頭還要高的作物，這是一片健康的玉米田，而透過鏡頭您可以看到另外一塊呈現相當大的對比，這是被秋行軍蟲侵襲過的田地，上面的作物已經拔除而且焚毀又拉起封鎖線，而您再看到在它旁邊通常也架設起像這樣的白色的性費洛蒙誘蟲器，要透過化學氣味撲殺成蟲。」
同個農地、兩樣光景，一周前還是初長成的植株，如今已被剷平，地上還遺留焚燬痕跡。
有機農友黎盛忠：「當時我們發現的時候都在比較小的植株裡面比較有嫩葉，目前就是比較高的植株裡面就是葉子比較老就沒有發現有秋行軍蟲。」
三塊總共兩分半大小的田地，暫時都無法耕作，但對於農友來說，還有其他隱憂。
有機農友黎盛忠：「在市集賣的話，很多客人會問你這個有沒有被秋行軍蟲爬過，會不會有毒或怎樣的，可能大家都誤會，牠只是一般蟲，牠是比一般蟲更會吃嫩葉，對農作物的損害更大，其實沒有毒。」
秋行軍蟲影響產量但不影響農作物本身，但民眾的不安心感，也成為這波蟲害的另類農損。而目前的通報案例寄生宿主都是玉米，恐怕也會衝擊產量。
農委會防檢局局長馮海東：「預期大概食用玉米可能不會很嚴重，比較有機栽植的它的衝擊會大一點，因為它無法什麼其他的防治技術，其他的這種算是比較友善耕作的作法，不使用化學藥劑的話是不是能夠控制的住，那這個我們還有待觀察。」
秋行軍蟲全台肆虐，從6月8日飛牛牧場首例以來，確認案例已達到155件，僅南投、嘉義倖免，就在台灣本島確認成蟲後，全台啟動第二階段防疫，但政府、學者都坦言，秋行軍蟲已難根治。
台大昆蟲系教授徐爾烈：「見招拆招，牠在什麼地方危害我們就那個地方去防治，因為全面消滅不太可能，因為牠除了我們的農田以外，可能在野外，非作物的植物上也可能會有。」
學者強調，秋行軍蟲不僅適應力強，更難纏的是容易產生抗藥性。
目前的防疫措施，從銷毀掩埋作物改為強制噴藥，畫定緩衝區巡查卵塊及幼蟲，並輪流施藥，管制期則延長到作物生長季結束。
防檢局局長馮海東：「會用費洛蒙的誘捕裝置會去調查牠在田間的密度，那密度高的時候通常就會對農民發出警訊說這個蟲子最近比較多，那哪一些基礎作物就要開始重視要去巡田要去作防治，那這個機制我們在其他幾個夜蛾類的害蟲已經存在，將來的話如果這個蟲確定(在台灣)立足，牠也是變成其中的一種，那將來我們也是會發出類似的警訊。」
秋行軍蟲在非洲、印度、大陸造成嚴重危害，農委會認為，主因和大面積粗放管理有關，而台灣以精緻小農為主，就算未來要和秋行軍蟲共存，危害相對容易控制，目前防治資料庫和對應藥物正在建置，未來視蟲害狀況，最快一個半月以後，就會輔導農民自主管理施藥。
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