許多人生病時都會接受抗生素治療，當症狀緩解後，往往認為可以回歸日常，但其實抗生素吃完只是第一步。醫師張家銘指出，抗生素雖然可以有效清除壞菌，但常常也會連好菌一同消除，因此需要透過調整飲食「重建腸道菌叢」，把好菌養回來，讓壞菌無法趁虛而入。
醫師張家銘在臉書粉專《基因醫師張家銘》發文表示，抗生素治療常用於泌尿道感染、肺炎、腸胃炎，或者手術前後的預防性用藥，在臨床上，時常遇到病患症狀緩解，但人還是沒有真正恢復，甚至出現新的困擾。
張家銘續指，曾遇過一名80歲女病患，年輕時接受過子宮大手術，膀胱功能受影響，導致反覆泌尿道感染。每次她發燒、尿急、小便灼熱，照標準流程驗尿、做細菌培養，確認細菌給抗生素後，症狀雖然很快就改善，但每隔幾週又會因為類似的症狀回來就診。後來他請該病患在抗生素治療後補充益生菌，並調整飲食，復發狀況才大幅減少。
抗生素救命，也會殺光好菌，真正關鍵在於後續如何重建「菌叢」。張家銘說明，根據研究顯示，若要「重建腸道菌叢」不能只吃益生菌，也要提供適合好菌生長的環境。菌與菌之間會合作消化纖維，互相產出有用的營養物質，比如丁酸、醋酸、丙酸，這些都對腸道修復、免疫穩定非常重要，但若每天吃垃圾食物，好菌就會沒東西吃，而壞菌也會趁虛而入。
他建議，腸道的修復可以從補充膳食纖維開始，因為高纖蔬菜、根莖類、豆類、全穀雜糧、未加工的堅果，這些日常就能做到的食物，是重建菌叢的根本。這樣不僅能縮短抗生素後的不適期，也真正降低復發風險，減少未來反覆感染與慢性發炎的後遺症。
