台南新營太子宮驚傳有女秘書任職期間長期侵占公款，金額高達3300萬台幣，據了解，該名曾姓女秘書兼職會計，疑似是與廟方主委產生嫌隙，引發內部鬥爭，於2017年退休時，遭廟方發現任職30年來連續作假帳、侵占2900多萬元善心捐款與香油錢，4月29日台南地院民事庭判決出爐，曾姓女秘書需返還這筆鉅款。
曾女表示過往在廟任職時，財務出納就是管帳的不管錢，管錢的就不管帳，支出也都要皆需要主委、總務、財務、出納等，經過六顆印章蓋章才能通過。曾女堅稱未曾侵占公款，5月7日的刑事判決她獲無罪，4月29日的民事判決卻判她侵占，讓她看不懂，民事一定會上訴。
