萬宜颱風持續在日本釀成慘重災情，從南部的琉球，到中部的名古屋，各地紛紛傳出淹水、坍方與土石流意外，至少造成3人死亡，1人失蹤，還有超過60人受到輕重傷，陸海空交通更是一團混亂，多個新幹線班次臨時停駛，乘客只能在車上過夜，苦不堪言。
巨浪捲上岸，鷹架砸轎車，山路裂大洞，鐵軌變小溪；萬宜颱風夾帶超級破壞力，橫掃日本西南部，所到之處一片慘狀，山區出現土石流，多戶民宅當場被淹埋，居民倉皇逃生，驚恐全寫在臉上。日本災民：「一瞬間就淹進來了，只差幾公分，我家就完全滅頂了。」
低窪地區則是一片汪洋，不論是機車或汽車，都動彈不得，不得不出門的民眾，更是雨傘開花，寸步難行；各地消防隊緊急出動橡皮艇，搶救行動不便的老人家。
受到颱風影響，不少電車開到一半停駛，乘客在風雨中下車步行，新幹線更是班班取消，乘客苦等一上午，就是看不到車子。日本乘客：「我等了3小時，坐得臀部超痛。」日本乘客：「本來要到大阪吃喜酒，這下子能吃到半攤就不錯了。」
另外機場航班，也有240個國內線班次取消，趕著回家的旅客擠爆了機場大廳，目前萬宜颱風的暴風圈，正通過日本關東上空，緩慢往東移動，而今年第一個登陸日本的颱風，就釀成如此嚴重的災情，已經讓日本民眾擔心這個颱風季節要怎麼渡過。
