日本航空客機2日在羽田機場跑道，衝撞準備運送物資至地震災區的海上保安廳飛機，導致5名海保廳職員死亡、機長重傷。事發當時，日航客機接獲管制員指示，准許降落跑道C。海保機僅被指示在跑道前方等候，卻因不明原因進入跑道，引發這起重大飛安意外。據了解，海保機上6人可能全誤會管制員的指示，以為他們能夠優先起飛。
《產經新聞》報導，根據通聯記錄，2日下午5點45分，管制員向海保機指示「No.1，請滑行至C5的跑道停等點」。機長於8秒後複誦管制員的指示後，卻直接進入跑道，於5點47分和降落的日航客機發生衝撞。
海上保安廳關係人士透露，除了倖存的機長外，海保機上總計5名人員，全員皆有配戴含耳麥的航空耳機，可以聽到機長與塔台的對話。機長獲救後堅稱，他在意外前有接獲管制員的許可，且其他機組人員都有聽見指示。
《NHK》報導，國土交通部指出，通訊記錄中的「No.1」指示，指的是日本航空客機降落後，海保機能以第一順位起飛。但海保機聽到「No.1」一詞，可能未察覺準備降落的客機，誤以為已獲得優先起飛許可。
國土交通部同時表示，若飛機起降中的跑道遭其他飛機闖入，塔台畫面上的跑道將會亮黃燈、飛機將呈現紅色。意外發生時，此警示機能有正常運作，但管制員當時可能未察覺。國土交通部指出，日航客機的機長當時也未目視到海保機的存在，應是多個人為失誤導致這場意外。
