要不要特赦前總統陳水扁，一直都是民進黨的燙手山芋，因為前法務部長邱太三才被爆料，是因為得罪陳水扁而下台，不過總統府秘書長陳菊卻一改以往支持特赦扁案的態度，坦承陳前總統如今還有案件在審理，不適用特赦。
民進黨立委羅致政：「不是要不要的問題，而是如何，也就是說如果要解決的話，那赦扁的法律面相上如何來克服，在很多案子還在進行當中，沒辦法處理或是沒辦法特赦，那塊法理上如果不解決的話，即便做了政治決定，也不容易達到目標。」
前法務部長邱太三才被爆料是因為得罪陳水扁而下台，如今燙手山芋丟給新任法部部長，綠營基層施壓的聲浪也逐漸變大。
民進黨立委許智傑：「南部還是有很多挺扁的聲音，我還是建議就是我們要趕快來修『特赦法』啦，假設5年後改朝換代，又把他(陳水扁)再辦一次，那這個就沒有意思。」
提議說要修改特赦法，總統府強調，陳菊的立場和總統一致，但對於態度轉變問題也不多做回應，只是選前赦扁議題無解，也難保不會動搖民進黨基層信心。
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