台大校長遴選引爆政界和學界角力戰，挺教育部的一派認為，大學自治不能無限上綱，需要合法性監督和外部制衡；堅持大學自治精神的學界人士認為，就算現行《大學法》有瑕疵，但依法遴選的結果就必須遵守。不過交大校長張懋中點出，由於教育部跟各大學之間存在「監管」關係，各校難以發展特色，會讓台灣失去競爭力，未來「大學法人化」恐怕勢在必行。
台大退休教授陳國華：「發現後來有人來搗蛋，破壞撕我們的那個標語，那我們就決定了(24小時輪班)，維護這一個大家所形成的精神堡壘。」
師大聲援校友：「不知道(政府)能夠橫行霸道到幾時，我希望能夠在這邊啊，能夠喚起全民覺醒。」
退休教授、校友，甚至還有校外人士，自願頂著大太陽靜坐，24小時輪班鎮守，教育部拔管事件沸沸揚揚，卻並非所有台大學生都有感。
台大學生：「我沒有認為哪一邊是絕對正確的，我覺得學校可以穩定運作就沒有問題。」
台大學生：「(距離畢業)剩下一點點時間，只是想說那個畢業證書上面，不知道會寫誰的名字。」
教育部拔管，冷熱反應兩樣情，不過連清大、交大、中央等大學都群起反彈，關鍵就在大學自主4個字。
國立台北商業大學校長張瑞雄：「大學是一個公共財，政府給你錢 ，並不代表說我就是政府擁有的，你想要管，你就把辦法定清楚嘛！對不對，就是說遴選人被選出來之後，要經過教育部的『核定』或是『核備』或是核......就是要有一個『核』字。」
台北商業大學校長張瑞雄也呼籲教育部收手，尊重大學自主。
東吳大學前校長劉源俊：「未來解決這種問題的辦法，就是國立大學要法人化，校長產生就完全由這個理事會，它再組一個遴選委員會來產生，這個就教育部就完全無權過問。」
由公務機關保護和限制，國立大學想打國際盃，可不能變成所謂的「教育部大學」，全看政府臉色，學界討論多年的大學法人化，是交付公益信託，讓大學脫離與教育部的上下從屬關係，雖然政府預算會減少，學校必須自籌財源；不過相對的，校方人事聘用、學費調漲、設備採購、財務監督也能全面鬆綁，校長遴選的爭議也才能全面解決。
國立台北商業大學校長張瑞雄：「兼任(獨董)沒報備的 ，每個人都被監察院調查，那為什麼會這樣就是因為，他們把我們當作公務人員，那法人化之後就沒有這些顧慮了，至少公教分離，就是說不要把這個大學教授，當作一般的公務人員來管理這樣子。」
華梵大學前校長朱建民：「教育部現在的做法很簡單，就是說因為這個(大學)法不夠完美，所以我要迴避它、我要挑戰它，這個不對，大學法人化成立了，到時候問題並沒有辦法完全解決，因為在裡面還是一樣的，太多的折衷跟沒有預期到的問題。」
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