選前到處第3個夜晚，國民黨主席馬英九晚間從彰化趕場到南投，喊出「政黨輪替」，對於行政院長謝長廷說他到富邦招待所吃魚翅，馬英九說當時只是公務往來，絕對合法。
台北市長馬英九：「這是個老問題了，在這個兩年前的時候，我們跟富邦換股協議完成的時候，有一個公務上的聯誼，我確實有參加，這個事情，監察院調查過，台北地檢署調查過，都沒有問題，結果都公佈出來了，我們政府跟企業正常的交往，應該可以被允許的，所以我在這裡特別說明，至於其他不正常的交往，才是應該要管制、要取締的。」
馬英九一連從嘉義、雲林趕到彰化、南投替候選人進行最後衝刺，馬英九說這些民進黨執政的縣市長爭取連任，民調竟然輸給國民黨籍候選人，顯示他們做不好，因此最後關頭，馬英九喊出政黨輪替。
