李遠哲的公開信引起各方不同反應，李敖就批評李遠哲少了懺悔，因為當初就是他的推薦，讓陳水扁當上總統，如今應該不只要陳總統考慮去留，李遠哲自己應該也要為了看錯人，公開道歉。
就在在野黨對李遠哲公開信大表讚揚的同時，李敖卻覺得美中不足。立委李敖：「他就少了一句話，就是當年我推他推錯了，他少了一句懺悔，其他說的也很正確。」
李敖說的就是當年的這段錄影背書，被視為是把陳水扁推向總統2千年寶座的重要關鍵，不只要李遠哲坦承自己看走眼，也要李遠哲拿出干預政治的手。李敖：「他並不是萬能的，可是政治層面，他做了太多的錯事，對不對？教育改革，對不對？」
只是，這封信能對執政黨造成多大的影響，李敖並不看好。李敖：「因為阿扁不要臉，民進黨不要臉，所以沒有用。」
李氏風格，評論時政，全都是用罵的。
