馬英九特別費案，檢方的「突擊偵查」方式，成了檢辯攻防焦點！馬英九認為，首次問訊是以關係人身分遭傳喚，當場才被告知是被告，而且檢方是用誘導式問話。而馬英九在庭訊時，盯著電腦螢幕糾正錯字，並且回答時先看著律師團隊，顯示捍衛自己清白的決心與謹慎。
馬英九第二次出庭，仍然強調自己的清白，也引來檢辯激烈交鋒。
審判長一開始就問馬英九，檢方三次訊問，是否感覺被施壓？馬英九回答，第一次被傳喚，以為是以關係人身分，當場才知道原來是被告，他認為檢方根本是誘導性問話。北市府前法規會主委陳清秀：「馬市長那時候嚇了一跳，我自己也嚇一跳，我覺得說一個法治國家，正常的法律程序，應該要讓被告有委任律師答辯的機會，而不是突襲性，突然的才決定。」
就是依據陳清秀的說法，馬英九律師在庭上，把問題拋出，批評檢方根本是挖洞給人跳但檢方也立刻提出法條反擊，表示刑法並沒規範怎麼詢問當事人，否認預設立場。北檢襄閱主任檢察官林錦村：「偵查當中並沒有法院所謂交互詰問，規則的適用，所以也就沒有誘導訊問的問題。」
至於審判長詢問檢辯雙方，對於證人筆錄列為證據有沒有意見，馬英九律師表示，那些都是個人意見，不能列入證據，但檢方卻認為，當事人對於工作認知，所做的陳述，就有證據能力。
特別費案開庭，雖然還在準備程序階段，但除了檢方的訊問過程，是否違反程序正義，引發爭議，南北檢對特別費案認知的不同調，也成了攻防焦點。
只是馬英九在庭上，仔細盯著電腦螢幕糾正錯字，並且在回答法官詢問時，眼神都先看著律師團隊，顯示捍衛自己清廉、清白的決心與謹慎。
