立法院長韓國瑜，確定擔任台灣民主基金會董事長之後，公開指定「執行長」人選，引發綠營不滿，至今與主管機關外交部，也遲遲沒有達成共識。如今，台灣民主基金會現任執行長黃玉霖，就公開發布聲明，呼籲新任董事長，應該尊重慣例，採「民主協商」機制，選出新任執行長。
確定出任民主基金會董事長的韓國瑜，執行長一職想要自己任命，但民進黨團總召柯建銘再度呼籲，應放手讓總統決定。
民進黨團總召柯建銘：「執行長過去是總統，跟執政黨要在同一個立場上面，這個沒有人可以違法的。」
立委(國)王鴻薇：「董事長來派任這個是再正常不過，而且也符合章程，請問一下，明明章程有規定，到底要協商什麼。」
畢竟過去扁時期，朝小野大的時候，時任國民黨籍的，民主基金會董事長王金平，就接受陳水扁提出的林文程擔任執行長，但2008年政黨輪替之後，馬英九也沿用林文程，沒有主動換人，甚至未經所謂「民主協商」過程，
就連曾擔任基金會董事的柯志恩，也呼籲綠營該放手了。
台灣民主基金會前董事柯志恩：「我不懂為什麼過去，一向推行如故的狀況，會因為韓國瑜當上院長，甚至當上董事長之後，一切就要遭受到改變呢，外交部為什麼到目前為止還不放手呢？趕快召開董事會然後一切依法行政。」
牽涉藍綠角力，基金會爭議四起，追根究柢也是因韓國瑜而起。
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