國防議題是總統大位的必考題，民眾黨總統參選人柯文哲就拋出了「相信中共會從金廈大橋長驅直入」的人沒有軍事常識，因為若有問題，炸掉大橋便可解決。對此，國防部長邱國正回應，「第一步還沒達到，就談後面」，有點不切實際，不過也打趣地說，「沒有要打臉誰」。
國防部長邱國正：「第一步還沒達成之前，就談後面的話，我覺得有點不切實際，金廈大橋要納入國防範疇，不是不能討論，目前環境比較特別，萬一講什麼話以後，你們標題我都幫你們想好了『國防部打臉某某人』，我沒有打臉某某人好不好，我們就事論事。」
不過對於柯文哲指出炸橋很容意，軍事專家認為執行起來不一定是如此。
另外，雖然說國軍近年想定的情境是倘若共軍攻台，必定先瞄準攻擊本島、一次拿下首都，但專家認為這不代表離島就完全無礙。全球防衛雜誌編輯部主任宋玉寧指出，因為奪取外島，共軍知道將直接影響政府的威信和民心士氣。
於此同時，柯文哲近期頻拋國防政策，再搬出訪美心得，包括「我國國防經費應該要拉到GDP占比的3％」。不過其實馬前總統過去的競選承諾中也有這一條。而翻開近年國防預算，確實不斷成長：從5年前的GDP占比2%，到2023年，預算達5863億元、占比2.4%。只是如果要到GDP 3%，預估預算得高達7500億元。
國防部長邱國正：「我們當然希望越高越好，但是國防預算的編列是要整體來考量。」
其實美方高官，包括前美國防長艾斯培在內，就曾多次建議台灣應增加國防預算。柯文哲此時拋軍事見解，也被解讀似乎拚積極回答選舉隨堂考 。
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