數位發展部於8月底正式掛牌運作，因其編制員額600人，預算卻高達211億元引發關注。民眾黨立委邱臣遠今（9）日再提出質疑，指數位部聘用人員在數位部長唐鳳上任後膨脹成三倍。對此，數位部今下午回應，認為邱臣遠可能誤讀數位部相關組織法條文，忽略數位部還有轄下兩個署，才有膨脹三倍的誤解，強調相關組織法均經過立法院三讀通過。
數位部編制600員額當中，有300人是約聘人員，創下公務機關的用人先例。邱臣遠質疑，當初立法院聯席審查數位部組織法時，數位部約聘民間專業人士僅100人，但「唐鳳上任部長後卻大幅膨脹為三倍」，而約聘人力不需具備公務人員身分，不用考試、不限學歷、不受《公務人員任用法》規範約束，到底是幾職等聘用？是否經過公開評選？數位部至今都沒有對外說清楚，「不禁讓人懷疑是否為了豢養1450網軍」。對此，數位部發言人李懷仁表示，數位部聘用人員都是依法進用並受到聘用人員相關法令規範與監督，更絕無膨脹三倍，數位部「一部兩署」聘用人員最高上限三百人，也就是數位部與轄下數位產業署、資通安全署，各上限一百人的合計。
對於遭質疑「聘用人員佔總員額一半」，李懷仁回應，「感謝民眾黨團去年就提出數位部聘用人員可以達總員額一半的主張」，去年立法院審理數位發展部組織法草案時，民眾黨團也提出黨團版草案，特別是在民眾黨團版第八條，提出考慮數位部人力來源多元與專業，因此主張擴大聘用人員到總員額一半，「邱臣遠委員也列名在民眾黨團版上，相信當時也支持民眾黨團版擴大聘用人員到總員額一半的主張」。
李懷仁說，可能是邱臣遠誤讀數位部相關組織法條文，忽略數位部還有轄下兩個署，才沒將兩個署的聘用人員各一百人計入，才有膨脹三倍的誤解。
李懷仁說明，數位部組織法第7條明確限定數位部本部「…其聘用員額不得超過一百人。」此外，數位產業署組織法第五條、資通安全署組織法第五條，也都有明文寫出「…其聘用員額不得超過一百人。」因此，一部兩署上限各一百人，最高上限三百人，強調上述的三個組織法都是經過立法院三讀通過。
李懷仁指出，目前數位部成立還不到一個月，聘用人員僅二十餘人，就像速限300公里，不會一下子開到300，但是會穩定起步，而數位部的司署長目前都是常任文官，各司署編制內如有聘用人員，也都全權由這些常任文官的司署長進用與調度指揮，嚴守行政中立。
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