前新竹市長林智堅深陷論文抄襲風波，先前被台大認定抄襲余正煌論文屬實，更有可能遭撤銷學位，也因此退選桃園市長；而其指導教授、現任國安局長陳明通也成了箭靶，對此，前立委林濁水昨（13）日表示，他認為陳明通被罵過頭了，要替他講幾句話，「他雖然長袖善舞，卻不是靠指導論文升官的」。
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針對林智堅論文門事件，林濁水昨在臉書表示，「陳明通被罵過頭了，該替他講幾句」。林濁水說，自己曾批評過陳明通指導論文的做法，「只是他雖然長袖善舞，卻不是靠指導論文升官的」。
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林濁水指出，陳明通早在2000年時擔任過陸委會副主委，就已經是副部長了，2007年後更兩度擔任陸委會主委，政治地位高於立委、新竹市長，何必倒過來「向下拍馬」以求官，最後直呼「要把人罵得那麼慘，無論如何，要嚴肅一點認真一點」。
事實上，陳明通曾多次公開力挺林智堅的論文，稱是自己將林智堅的民調資料提供給余正煌，然而，隨著台大召開記者會認定林智堅論文抄襲屬實，且情節嚴重，外界針對陳明通的質疑聲浪也隨之而來，台大也說已經收到檢舉，將啟動對陳明通的學倫調查。對此，陳明通則透過友人轉述，如果台大對他啟動學倫調查，他將進行完整說明；至於林智堅及余正煌兩位學生論文的完整脈絡，他之前已經完整說明，請各界明察全貌。
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