中國大陸日前以「檢出禁用藥物」為由，於6月13日起暫停台灣石斑魚輸入，今（29）日又再稱從台灣2批石斑魚檢出藥物，國台辦發言人馬曉光直言，說明相關問題根本沒有得到解決。對此，農委會做出回應表示，近期沒有石斑魚活魚運至中國，且已提出檢驗合格證據，中國至今未回應，有疑問可協調國際機構檢視，而非透過國台辦無的放失，「中國政府既提不出科學證據，也不遵循國際規範，胡亂指控，令人不解和無法接受」。
農委會表示，自6月10日中國發布將於6月13日起暫停我國石斑魚輸入中國後，我國即未有輸中的石斑魚活魚運送至中國。
農委會指出，針對上次中國所指控我國石斑魚養殖場有禁藥檢出之問題，農委會漁業署立即針對中方所提供資訊，回到產地將11家養殖場進行採檢養殖場內的魚體、底土及池水，送交實驗所檢驗，結果顯示包含四環黴素類、孔雀綠／還原型孔雀綠、結晶紫／還原型結晶紫等皆未檢出。
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農委會說，透過科學證據證明我國的石斑魚安全無虞。並於6月17日透過兩岸動植物檢疫聯繫平台提供給中方，迄今未獲得回應。有關今日國台辦再次聲稱石斑魚的藥物檢出，為何中國國台辦不向他們的海關總署詢問我方提供的科學證據，「如果中方對於我方提供的科學證據仍有疑問，歡迎透過國際或第三方驗證機構來共同檢視，而非透過國台辦無的放矢」。
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農委會表示，針對有關國內石斑魚的用藥及生產安全管理，2000多戶石斑魚養殖戶皆配合農委會的安全用藥管理。為避免少數業者違規，農委會在產地全面監控及檢測結晶紫／還原性結晶紫。今年目標抽驗120件水產品，迄今檢驗100件（石斑84件，午仔16件），均未檢出。
農委會強調，我國從事農漁畜產品出口貿易皆依照國際規範，並遵循相關國際標準程序，無論是美國、日本等皆可順利完成農產貿易，「惟獨輸入中國被冠以莫須有的汙名，這對兩岸農產品貿易沒有助益，中國政府既提不出科學證據，也不遵循國際規範，胡亂指控，令人不解和無法接受」。
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