首批滯留在武漢的台灣人三日深夜回台後，現在陸委會暫緩第二批民眾返台，陸委會發言人邱垂正表示，第一批返台旅客中，多數不是所謂的優先旅客名單，而居中協商的台商會長徐正文也透露，第一批回台的確診個案，不在原本的登機名單。
總統蔡英文才在臉書上發文感謝大陸，在台灣人返鄉的過程中給予協助表示肯定，疫情當前，人權跟人道要優先政治考量，但原定2月5日回台的第二批包機卻緊急喊卡，讓不少還滯留在武漢的台商相當失望，陸委會這樣解釋。
陸委會發言人邱垂正：「接回第一批247人，是有賴雙方的合作跟各界的協助，我們都很感謝，但是有很多短期的、急迫性的、弱勢的並沒有優先回來。」
台北市家長會長協會總會長徐正文：「第一批回來的人也有一些老弱婦孺，就是它的比例不是占最多數，那也有一些是台商，也有一些是有疾病患者的部分，那沒有(搭到的)就是可能，我在想當初他是不是因為就近原則。」
陸委會表示，對岸未來要把完整的旅客名單，在起飛前一天交給我方，並把返台包機喊停，歸咎在大陸要與我方協商達成一致，大陸國台辦回應，截至2月4日，大陸共向台灣通報疫情36次，台灣向大陸通報15次。
另外由於首批返台旅客中，有一確診患者，陸委會還會持續跟對岸協調，如何加強防疫，隔離所也有容量的限制，要做好準備，才會執行下次任務。
《TVBS》提醒您：
因應武漢肺炎疫情，疾管署持續加強疫情監測與邊境管制措施，
如有疑似症狀，請撥打：1922專線，或 0800-001922，
並依指示配戴口罩儘速就醫，同時主動告知醫師旅遊史及接觸史，以利及時診斷及通報。
＊疾管署提醒民眾謹記「一不三要」戴口罩原則：
「一不」：開放空間不用戴口罩
「三要」：慢性疾病患者、有呼吸道症狀者、進出醫院者要戴口罩
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