吳敦義新內閣今天正式交接，其中被視為馬系人馬的人，比劉內閣還要多，指標就是馬市府時代的教育局長吳清基，終於入主教育部；另外，馬總統過去幕僚江宜樺，更高升到天下第一部內政部；而且大部分「馬團隊」的閣員，這一波改組，也都沒有被換掉，看的出來，馬總統對這次的內閣名單，著力甚深。
被稱為國民黨孤島的吳敦義組閣，閣員要從哪裡找？原本想走的研考會主委江宜樺，因為馬總統的親自挽留，居然轉任第一大部-內政部；教育部長吳清基，則是馬市府的教育局長，當初與劉內閣失之交臂，這回總統當然不會忘了他，看的出來這新內閣，馬總統著力甚深。
教育部長吳清基：「沒有什麼系，什麼系啊，就是為教育專業來打拚，為孩子的教育、受教權益來努力。」
其實不只高升的江宜樺、吳清基，劉內閣中被認為是馬系人馬的閣員，包括政務委員薛承泰、財政部長李述德、主計長石素梅、新聞局長蘇俊賓、環保署長沈世宏、公共工程會主委范良�，以及客委會主委黃玉振，幾乎全數留任。
而被換掉的國防部陳肇敏、外交部歐鴻鍊，還有經濟部尹啟銘，則是被認為沒有派系背景，因此有沒有馬總統關心的眼光，真的差很多。
國民黨立委吳育昇：「這些市府團隊變成馬團隊的話，的確會有這個優點，就他比較理解總統的思維，那總統也了解他們的特質，那專業的用人很清楚的。」
了解馬總統的立委說，馬總統很尊重吳敦義組閣的意願，但馬系人馬陸續進駐戰鬥位置，「能精準掌握總統意志，推動國政」，或許是這次內閣改組最高指導原則。
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