美國眾議院議長裴洛西訪台觸怒中共當局，實彈軍演外，國台辦針對台灣4家企業、基金會進行封殺，其中，被列為台獨頑固份子的「台灣民主基金會」，其政黨代表，還包括國民黨立委陳以信、高雄市長參選人柯志恩，等於2人皆遭陸方歸納為台獨人士。對此。柯志恩回應，這是陸方的過度解讀，「我們是民主的頑固份子」。
另外，隸屬外交部的2基金會，「台灣民主基金會」、「國際合作發展基金會」也被馬曉光指出，打著民主的旗幟，實際從事台獨分裂活動，破壞一個中國的原則。而台灣民主基金會除了董事會高層吳釗燮、立法院長游錫堃，政黨代表有民進黨的羅致政、林飛帆，以及國民黨的陳以信、柯志恩，等同於柯志恩也被列入國台辦所歸類「台獨頑固份子」的黑名單中。
對此，柯志恩回應，是中國大陸過度解讀，「我們不是台獨頑固份子，我們是民主的頑固份子」，柯志恩也向陸方喊話，不要出現過激反應，尤其不應該以軍事手段來威脅台海安全，並要執政黨做好可預期之經濟制裁的萬全準備。
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