普悠瑪翻覆事故，大家都想知道關鍵ATP為何會關閉，台鐵一開始說是司機員自行關閉沒有通報，但曝光通聯紀錄顯示，關閉狀況是有回報的，而且行政院也透過新聞稿同意這樣的資料判定，形成雙方不同調的窘境，而專家和立委就認為應該積極推動第三方鑑定機構的成立。
質詢台上砲聲隆隆，針對普悠瑪翻覆，台鐵副局長始終無法回答眾多疑雲。
記者詹舒涵：「面對立委質詢台鐵說法前後不一，我們就來看到關鍵的ATP系統在2006年的時候全面安裝，2007年再度發生了重大事故，因此嚴禁司機員自行關閉ATP，而到了2010年的時候後，又加裝了遠端監控系統，不過如今普悠瑪翻覆，台鐵表示沒有辦法遠端監控，因為普悠瑪的型號比較新穎沒有加裝，而前後說法兜不攏的情況之下也讓真相撲朔迷離。」
律師劉韋廷：「重大的交通建設的發生的這種公眾的意外，它其實是需要調閱很多的人來詢問，以及調閱很多的書面資料、調閱很多的畫面，說實在的，在本案當中台鐵它可能就是一個，我們講法律上面有可能像是共同、正犯、共犯的角色，或者是一個共同被告的角色，所以當然它的角度上面，可能跟我們第三方來做判讀的角度上面有一些不一樣。」
律師認為事故真相各說各話，台鐵角色根本球員兼裁判，專業鑑定到底在哪。來到新北刑事鑑定中心，針對交通事故車身碰撞，仔細採樣分析，這次新北沒有參與事故鑑定，但過去也曾參與蝶戀花事故，被問到交通事故的鑑定狀況，員警坦言需要許多專業人員。
新北刑事鑑識中心股長陳泰宏：「一般的交通事故就是，車漆的一個轉移那車漆轉移就是可以做，車漆的採證那如果說有一些大體它有一些沒有辦法辨識，這時候也會採集他的DNA。」
而目前台灣針對交通事故，只有大園空難後所成立的飛安會，立委也督促應該盡速成立，國家運輸安全調查委員會。
立委鄭寶清：「這個單位成立以後，等於這個單位在監督交通部，所以交通部就是抵抗，等一下說這個組織困難，等一下說要編預算，現在就是說他們自己調查通通都沒用。」
交大運輸與物流管理兼任副教授黃台生：「所有大的事故包括高速公路，應該要有一個國家級的那個調查委員會。」
翻覆意外真相不明，要讓軌道運輸安全回家的路上，還需要更多公正透明。
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