超商提供多項代收服務，包括停車費、國道過路費等等，而目前非使用eTag用戶，到部分超商繳納國道過路費所衍生的5元手續費，仍是由遠通吸收，對此遠通認為當初合約上並未載明這件事，因此提告高公局要討代墊的2483萬手續費，不過遭台北地院以「高公局沒有不當得利」判敗訴。
民眾：「理論上民眾，想要享受這個便利的話，他們應該自行吸收。」
民眾：「政府已經提供這種特許行業，給遠通去運作，那他就不應該再跟民眾，收取這樣的服務費。」
民眾看法兩極，而對此遠通強調，當初和高公局簽立的契約，只載明負責吸收eTag用戶的儲值手續費，而沒有使用eTag的用戶，合約沒有載明繳費手續費必須由遠通吸收，才會提告。
而目前超商除了代收國道過路費，取高鐵、台鐵甚至客運車票的費用，因為提供便利性，都會分別收取8元或10元的手續費，類似「服務費」概念，至於停車費代收不收手續費，超商業者表示，是因為停車費繳納類似「繳稅」概念，因此不需要再另外加收手續費；而這次遠通、高公局，因為代收手續費鬧上法院，是否會再上訴，遠通表示還在研議。
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