原本是安心、衛生的GMP標章，在這次食用油風暴當中，慘遭滑鐵盧，還可能因此賠上24年累積的好名聲，因為這次出包的，大多是通過GMP認證的廠商，再加上平面雜誌披露，工業局負責GMP的僅是業務的一小環，從送件審核到查廠，更只有1人把關，至於技術檢測是委外處理，民間GMP協會也只負責推廣，顯然這個注重「食品製程」的標章，已經讓民眾不能信任，也因此，反倒讓坊間的檢測單位，業績量暴增。
收集食用油樣品，再滴入乙醇，小小試管不稀奇，但這可是為了要測「棉酚」，經過振盪器30分鐘的均勻混合，還得送入高速離心器，原本黃澄澄的食用油，馬上上下分離。
實驗室副理陳淑媛：「因為有油脂嘛，跟加有機溶劑，他們比重不一樣，所以他們會分層，取上面這一層，再過濾上儀器(分析)。」
最後步驟，就是放入這台要價250萬的「液相層析儀」當中，馬上就能跑出數據。陳淑媛：「一般油品的話，我們會常檢測重金屬，抗氧化劑還有酸價碘價，或者是說像一般花生油，有黃麴毒素的疑慮的話，都會有檢測，這一陣子是案件有增加的趨勢。」
食用油爆發食安危機，這也讓民間檢驗單位忙翻天，除了例行檢測得進行，更多的是，要應付層出不窮的電話詢問，但這背後多少也突顯出來，台灣民眾心理的恐慌。
立委陳亭妃：「它(政府)所有的公權力都喪失了，我覺得應該去檢討政府的公權力，那如果說直接要廢標章的話，那麼可能很多台灣的標章，都要廢掉，因為每一個標章，都曾經出過問題。」
打出微笑、又手比OK，「GMP標章」出包，讓這個從1989年，就開始推廣的標章，深陷陰霾，但別忘了，GMP注重的是「食品製造過程」，屬於自主性管理制度，簡單解釋「產品的品質」，只能取決於廠商良心。
經濟部次長杜紫軍(2013.10.24)：「風險比較高的，作為第一優先，當然現在食用油脂，我們把純油的部分做完，調和油的部分，馬上就接著做。」
主管機關經濟部，當然想要亡羊補牢，畢竟加入GMP協會的460多家廠商，一年產值逼近3000億，相當於台灣食品業產值的6成，通過認證的就有3629項產品，但出事卻不是頭一遭，有一說是因為平均每年，採樣抽檢的項目頂多50件，佔全部品項僅有1.3%，再加上工業局屬於行政單位，負責收件申請，審查決定、技術性的檢驗，則必須委外處理，就連由廠商組成了GMP協會，也只是負責推廣工作，不管是多頭馬車，還是球員兼裁判的聲浪，才會沒停過。
立委陳亭妃：「本身又拿了政府的標案，然後又拿了廠商的計畫，一方面你在做監督角色，要做查廠，你又拿了廠商的計畫，是不是會校長兼撞鐘？」
杜紫軍(2013.10.24)：「如果我跟各位說明說，技術上驗不出來(比例成分)，各位一定會講說，那政府怎麼會這麼無能，這種東西都驗不出來，現在很多人這樣想，我跟你講，技術驗不出來，就需要用配合行政查核的方式，從它的進料、生產跟出貨，去做勾稽比對。」
即便極力想說明自清，但技術面就是無法突破，再加上對工業局來說，負責的民生化工組只有6個人，而GMP也不過是產業推廣業務的一小環，所以從送件申請、書面審核，到現場評核、以及產品採樣，向來都是1人作業，想要盡善盡美，比登天還要難。
全國公證檢驗公司經理張毅偉：「進了門檻之後，還要不定期地去抽查，去維持整個認證規章的系統和品質，可是我們現在比較多，看起來的情況，一樣就是人力短缺的問題，它好不容易，花了好大力氣審了之後，大家就覺得人性本善，就會好好地做，但不可能啊。」
現在經濟部打算委託民間單位，在3個月內，全面檢測3千多項的GMP產品，要給消費者一個交代，但已經24年歷史的GMP制度，失守淪陷後，現在想盡辦法亡羊補牢，也都比不上食安危機現形的恐慌。
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