中研院院長李遠哲，四年前以國政顧問團的身分，支持陳總統，今年他則是在投票前兩天，再度表達支持扁呂配，李遠哲說，台灣要繼續改革，一定要向上提升，不能往下沉淪，他還想對連宋說，四年過去了，應該讓中生代出來，讓台灣邁向更好的境界。
四年前，李遠哲以錄製錄影帶的方式，表達支持，四年後，他選擇公開出面，同樣力挺扁呂配，而支持的理由，同樣都是台灣要向上提升，不能向下沉淪。中研院院長李遠哲︰「我看到很強勁的一股力量在向上提升，但是另一方面我們也看到往下沉淪的這股力量還是很強，我們如果不繼續改革的話是不行的。」
總統陳水扁︰「用更大的決心跟更大的堅持來達成台灣不斷的向上提升，阿扁非常感謝李院長的提醒，也願意承諾，願以更謙卑的心來兼負全民的託付。」
中研院院長李遠哲︰「我心裡很高興，我剛才講的，我們真的要努力，要把國家帶到更高的境界，我們沒有任何的空間和時間再空耗下去，在政黨惡鬥下，耗損下去。」
期待台灣真的能夠向上提升的心情，寫在臉上，李遠哲同樣有建議，要給連宋配。中研院院長李遠哲︰「四年前他們落選之後，到現在已經四年了，但是有一樣事情，我是希望看到就是，我們是希望看到中生代把台灣帶到更高境界。」
陳總統和李遠哲在講這些話的兩個多小時前，陳由豪口中的民進黨大老沈富雄才剛露面，兩個人直接或間接，做出回應。總統陳水扁︰「就是因為阿扁不向黑金妥協，才會有所謂的黑金集體反撲，阿扁有絕對的信心可以勝選，也相信改革，一定會繼續，一定會成功。」
中研院院長李遠哲︰「沒有聖賢豪傑是沒有缺點的，但是我們不要抓住一個小小的毛病，就把一個人打死掉，誰和誰的事情是影響選戰的因素，我想應該不致於，沈富雄怎麼樣陳由豪怎麼樣，這都是小事，看誰能夠真正做大的改革，把國家提升到更高的境界。」
當陳由豪事件對陳總統選情造成一定衝擊的時候，李遠哲選擇站出來，他以諾貝爾獎得主，中研院長的身分，希望讓台灣人民知道，他站在哪一邊。
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