儘管泛藍陣營對於選舉結果表示無法接受，但是陳總統已經在擘畫未來施政的目標，就是在不改變現狀的前提下，進行憲政改造，並且積極推動兩岸和平穩定互動架構，陳總統說，他現在沒有競選的壓力，他會放手去做，他希望複雜難解的兩岸關係，能夠在他任內有所突破。
陳總統順利連任，未來4年他有2項重大目標，首先將推動憲政改造。總統陳水扁：「如何提高國家的競爭力，這是我們憲改最主要目的，不要枝枝節節應該要全盤翻修，但是最重要的一個原則，就是在維持現狀的基礎之上不改變現狀的基礎之上，我們來進行憲改的相關改造工程。」
按照陳總統過去的說法，2006年將會制定台灣新憲法，同時在不改變現狀的前提下，陳總統要改善兩岸關係。總統陳水扁：「明天我會請李遠哲院長來深談，這也是選前阿扁所說的，希望在選後320之後能夠來展開有關兩岸和平穩定互動架構的推動，今年320是我最後一戰，所以我更可以放手去做為海峽兩岸這個問題，儘管複雜難解，我希望可以盡我最大的一個可能，能夠有重大的改善與突破。」
總統陳水扁：「過去4年有人一直認為說阿扁是少數總統，政府是少數政府，因為我們只有40%的支持，那你今天不管怎麼樣，50%對50%怎麼會比40%對60%更困難。」
陳總統說，他一定會不分族群，用人唯才，注重品德操守，並且積極推動新十大建設，過去4年的困境，未來不會再出現，儘管泛藍陣營對選舉結果還有質疑，但陳總統已經在擘畫遠景，宣示要做個全民總統。
