受到少子化衝擊，據教育部統計，112學年度有16所公、私立大學停招或是裁撤學士班，113學年有51校、5898名額寄存教育部，連在職碩士專班同樣受影響，中華、淡江、大葉等大學都有專班停招或減少名額，雖然教育部認為尊重各校規畫，但是專家就表示，由於碩專班是私校金雞母，未來狀況惡化會衝擊中後段私校財務，學店化的情形也會更嚴重。
對於寄存名額達18名，淡江表示，因為青壯世代有碩士學歷者比較多，考量就讀的高階主管人員漸漸減少，各系所停招是考量到產業變化、少子化等綜合因素。
至於中華大學曾爆發林智堅論文抄襲案，113學年碩士在職專班招生名額也減少24個，停招的有行政管理學系、資訊工程學系、高階資料庫管理碩士在職學位學程等3個碩專班也停招。該校回應，每年會因應招生狀況調整，這3個碩專班是招生狀況不佳，將名額移至比較有招生需求的二年制在職專班，名額也從258名增加50個至308名。
此外，大葉大學管理學院碩士在職專班國際企業組停招。教育部則表示，自103學年度起，開放學校自行評估申請調減（寄存）招生名額，學校也在招生名額總量內依比例調整各學制班別招生名額，更貼近學校招生現況調整規模，只要報教育部審核，原則都尊重學校規劃。
針對少子化衝擊到碩專班數量和名額，全國私校工會副理事長尤榮輝認為，碩專班是在職人士進修管道，且有利職場晉薪及升遷，由於學費由各學校自訂，所以成為營收金雞母，但現在學歷貶值，加上在職人士對學歷需求降低，以及少子化問題，碩專班供大於求，預料未來招生會更困難，且會造成中後段私校財務惡化，學店化恐怕更嚴重，盼教育部把關，並落實私校退場。
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