指揮中心今年2月20日宣布，今年新冠血清抗體陽性率監測開跑，預計上半年抽樣捐血人7千名，不過現在卻爆出有民眾不滿，衛福部在民眾捐血前沒有盡告知義務，自己的血液不想被當樣本，還要自己打電話給疾管署報備留下個資，認為權益受侵犯。
指揮中心二月宣布，為常規監測我國新冠病毒血清抗體陽性率變動情形，已請衛生福利部指定血液基金會配合辦理「新冠病毒血清抗體監視系統」作業，血液基金會將針對今年1-6月期間捐血者之血液留樣檢體隨機抽樣約7,000件，並將無從識別特定捐血人資料與0.5c.c.血液檢體，提供疾管署檢測新冠病毒抗體與分析資料。
指揮中心當時表示，捐血者檢體被抽到利用的機率不到1%，血液基金會預計今年2月下旬起將以電子郵件通知被抽樣到的捐血人，無電子郵件者則以紙本郵寄通知，民眾如不願意提供檢體給該監視系統利用，請於收到血液基金會信件通知後2週內，致電疾管署1922或0800-001922防疫專線，並請留下「血袋號碼」或「姓名、身分證字號及生日」資料，以利轉知血液基金會排除該檢體給疾管署使用，捐血人不同意提供該監測系統利用其檢體，將不影響其於捐血中心的任何權益，亦不會被註記，請民眾安心。
不過根據《聯合報》報導，有捐血者質疑，自己的血液不想被當樣本，但捐血前衛福部沒有善盡告知義務，認為三年前彰化縣衛生局和台大合作，當時推動萬人血清調查，結果反而遭到衛福部移送調查，但為何這次衛福部在沒有盡到充分告知情況下，就要推動血液調查，加上現在疫情趨緩，不明白今年推動調查的必要性。
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