機組員檢疫放寬後，就爆發諾復特群聚感染，疫情之後燒向全台，因此不少人都將機組員放寬檢疫，視為本土疫情爆發的破口。現在疫情指揮中心亡羊補牢，對機組員採取更嚴格管制，沒打疫苗的人，7月1號開始，必須執行7天居家隔離加7天自主管理規定。
中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中：「14天是一個總管制期，潛伏期最長就這個時間，這些相關的措施，當然就是因應就是說，最主要是要鼓勵大家打疫苗，針對有打過疫苗的，做相對的一些放寬他的管制。」
第二種類別的機組員，是接種第1劑疫苗滿兩週，但還沒有完整保護力，六月底前執行3+11，七月一日起改為5+9，只有完成接種2劑疫苗滿兩周，抗體檢測為陽性的人，才可以只要7天自主健康管理，結束日做PCR檢驗。
小兒科醫師林應然：「7加7是比較合乎一點道理，但當然也不是最好的一個策略，14加0比較好，因為你有可能不是在7天就發病，有可能在14天才發病。」
機組員檢疫從原先的5+9放寬到3+11沒多久，就爆發華航諾富特飯店也群聚感染，之後疫情燒向雙北到全台，因此不少人認為，這次本土疫情一發不可收拾，都源自於機組員檢疫決策出錯。
小兒科醫師林應然：「台灣已經社區感染了，事實上這個破口已經破了，說實在這個(防疫)已經不是那麼簡單的事了，變成他們(機組員)已經不是大多數的傳染源了。」
指揮中心亡羊補牢，針對機組員加強檢疫措施，只是這能對現階段台灣本土疫情有多少幫助，還是個大問號。
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