始終不開放入境普篩、或入境普篩後加碼集中檢疫，指揮中心立場很堅定，原因在於認為偽陽性比例高，容易造成醫療量能崩潰，民眾也會因為篩檢陰性後乖乖居家檢疫的遵從率降低。但有醫師質疑，指揮中心舉例的篩劑特異性有5%特異性誤差過高，才會導致篩出的偽陽性人數過高，對此指揮中心回應，這是根據最新的醫學期刊標準做的分析。
入境普篩風波吵好久中央還是一貫立場，說入境普篩不居家檢疫，偽陰性會進入社區若雙管齊下也會讓，採檢陰性的居家檢疫者遵從率降低，勞民傷財外，大量偽陽性被抓出來，不只讓醫療崩潰，同班機旅客也得被迫隔離。
疫情中心指揮官陳時中：「大量發現病人大量篩檢，大量的篩檢完大量的住院，大量住院後醫療承受不住，然後開始把病人放回去。」
但開放入境普篩，台灣真的承擔不起嗎？統計台灣醫療量能，負壓隔離病房約1千間，隔離病房近700間，清空病房病床數約3千多床，指揮中心擔心爆出真正病例根本容不下，而中研院研究員何美鄉，則給出建議把醫療資源留給重症患者，醫師蘇一峰也有不同看法。
胸腔科醫師蘇一峰：「這些偽陽性的個案，會慢慢的出現，比如一天2例差不多就這種速度，這種速度其實現在的醫療體系，也沒有說一定吃不下來啦。」
另外造成篩檢誤差，看的是篩劑的敏感和特異性，若照4月底指揮中心的篩劑敏感性特異性來看，應該只會篩出25人偽陽性，但到了8/22特異性從，99.99%降到95%，也讓偽陽性增加到1萬2475人，黃立民就質疑這數據似乎被高估。
胸腔科醫師蘇一峰：「沒有到5%這麼多啦，我想是小於1%，甚至更小是千分之一，因為我們調的數字(CT值35)，不是調到非常敏感的，我們是抓到比較不敏感的這區。」
對此指揮中心表示篩劑標準，是以國際醫學期刊的最新數據分析，順、逆時鐘各成一派，疫情沒結束恐怕都沒完。
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