台北大醫院比較好？花蓮慈濟醫院在短短半個月內，就有2名病嬰轉送台北台大醫院，警方兩度協助開道，雖然過程順利，但堅持北上轉院行為，引發各界討論，甚至打擊慈濟士氣，對此，衛福部醫事司長石崇良表示「花蓮民眾要對慈濟有信心！」
另外，2018年12月27日，花蓮慈濟醫院一名早產嬰罹患壞死性腸炎，治療多日情況未好轉，需轉診台大醫院治療，由於嬰兒狀況危急只能靠氧氣支撐，家屬發文懇請北上民眾讓道，最後在警方護送下，僅花2.5小時平安送達。
花蓮縣府認為，可理解「天下父母心」，但這兩起病例都可在花蓮慈濟處理，且對慈濟來說「恐怕會有不受病患及家屬信任的挫折感」。
根據《聯合新聞網》報導，衛福部醫事司長石崇良表示，重症幼兒到底有無轉診需要，需要醫師的專業評估，部分家屬認為台大醫院設備較佳，想自行轉診，但轉診對病人是一種風險，重症治療應以就近就醫為主，若有必要則採遠距資源照會，以「病人不動、醫師動」的原則進行醫療。
石崇良解釋，慈濟醫院不只是醫學中心，也是重度級急救責任醫院，絕對撐得起重症治療，醫療量能也絕不輸西半部任何一家醫學中心，希望花蓮民眾「要對慈濟有信心」；石崇良補充，若醫師評估重症患者真有轉診必要，無論哪家醫院都會協助聯絡轉診，再以救護車載送，千萬別自己轉院。
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