兩歲男童恩恩確診離世，家屬連月以來向中央流行疫情指揮中心與新北市府追討真相，但隨著橫向通聯等錄音檔遭曝光，一把火也燒向新北市長侯友宜，市府的公關處理也讓侯出現連任危機，許多藍營民代認為市府一開始態度過度消極，想大事化小，反而後續被政治操作，傷及市府與侯個人形象，影響年底選舉結果。
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不僅國民黨內部有意見，市府內部也對於高層處理恩恩事件頗不滿，認為一開始就應該公布所有錄音檔，免得招來黑箱、掩蓋等質疑，一名內部人士直言，「這就是公務員心態！」綠營擺明就是要把恩恩事件變成政治攻防，而市府想要大事化小，反而「愈補愈大洞」。
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據了解，國民黨立法院黨團看不下去中央甩鍋，6月初曾主動聯繫市府高層，盼能提供協助，黨團隨後在12日開記者會中指出，市府是遵照中央指引做事，且隔壁的基隆市做法也一樣，若做法無誤，為何指揮中心會在恩恩事件後更改指引？且恩恩爸聯繫1922等待了168分鐘，指揮中心同樣有責，衛福部長陳時中卻稱1922無公權力，簡直甩鍋。
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據悉，藍營內部也私下針對恩恩事件進行網路聲量調查，認為恩恩事件確實對新北市府、侯友宜有傷，但程度有限，主要是增加綠營選民對侯的不滿，至於中間選民的反感度，逐漸從新北市府轉嫁到指揮中心，且隨時間推進，整起關注度也降低。
新北市議員葉元之指出，一開始市府把整起事件當作時事回應，沒有意識到綠營透過府院黨全面攻擊，好比某特定市議員參選人從4月就拿到錄音檔，每天在政論上放一點消息，把檔案當做政治鬥爭的工具，根本不是為了替恩恩爸追真相。
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不少藍營民代認為，侯市府談程序、指引，卻忽略了民意情緒，讓事件愈演愈烈，雖然在恩恩事件處理上出現公關危機，不過綠營操作斧鑿過深，事件已演變成藍綠對決，讓中間選民厭惡，也降低了對侯的傷害，雖然適逢年底九合一選舉，但對侯友宜的影響與輔選力道有限。
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