眼睛疲乏時，許多民眾都會習慣拿出隨身攜帶的眼藥水，點一下減輕眼睛的痠澀感，不過食藥署提醒，眼藥水的操作並沒有大家想像中那麼簡單，如果錯誤的操作方式，可能導致眼藥水的效果變差，甚至增加副作用的風險。像是直接點在眼球上、點完沒有按壓眼頭，都會讓藥品劑量變少。
一般來說，點藥時，用手指將下眼皮輕輕拉開呈袋狀，將藥水或藥膏點入下眼瞼與眼睛之間的袋狀結構，然後閉眼，同時用手指按壓住眼頭的鼻淚小管開口，閉眼後可輕輕轉動眼球，使藥水能夠均勻分散到眼球表面，接著繼續閉眼休息約五分鐘。不過，有許多民眾經常將「藥水直接點在眼球、點藥後眨眼」，其實是常見錯誤。要讓眼藥水發揮最好的效果，最重要的是讓藥水在眼眶中能夠停留足夠的時間。眼藥水若是直接點在眼球表面，而誘發眨眼反射的動作，並促進淚水的分泌以排除眼睛裡面的異物，可能讓原本應該發揮效果的藥水無法停留在眼睛達足夠時間，而讓藥效大打折扣。同樣的，點完眼藥水之後，如果一直眨眼睛，也會將藥水擠出眼眶之外，讓藥品的效果變差。
另外，如果「點完藥水之後沒有按壓眼頭與閉眼休息」也是錯誤的，眼藥水要發揮效果最重要的是停留在眼睛達到足夠時間。除了眨眼睛的動作會將藥水排除眼眶，眼頭的鼻淚小管開口也會讓藥水流失使藥水從鼻淚小管流進喉嚨，不只會讓眼睛得到的藥品劑量變少，從喉嚨吃下去的眼藥水也可能增加全身性副作用的風險。因此點眼藥水的時候，應該使用手指頭按住鼻淚小管的開口，減少藥水的流失。也可以閉眼休息約五分鐘，讓藥水停留在眼睛的時間增加。
最後，如果有超過一種以上的眼藥水需要點，這時假設接續的點，會使後來點的藥水將前面點的藥水擠出眼眶，導致前一種藥品的效果變弱。因此在點不同眼藥水的時候，最好能夠間隔五分鐘左右，讓每一種藥水都能夠充分的吸收。另外，由於不同眼藥水的流動性不同，停留在眼眶的能力也不一樣，因此在點眼藥的時候，應該先點眼藥水，再點眼用懸浮液（藥水裡面有小顆的藥品微粒），最後再使用眼藥膏。
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