農業部畜產試驗所近年來致力於水牛保種、品種命名、試驗發展及產業推廣輔導等，希望逐年提升臺灣水牛的飼養數量。根據該所112年底的畜禽統計調查顯示，目前臺灣地區在養水牛頭數約1800頭，飼養最多的地區是花蓮縣豐濱鄉磯崎部落，但也僅剩2戶飼養水牛，數量約百餘頭，若不採取積極措施，水牛產業恐很快就會走入歷史！
臺灣飼養水牛已有300多年歷史，是早期協助農耕的重要幫手，全盛時期在養量達36萬餘頭，但隨著社會及經濟型態轉變，目前水牛在臺灣的飼養量已不到2000頭。
畜試所東區分所身為水牛的保種基地，除了保種任務外，也致力於水牛的各項研究。該所於民國99年首次完成臺灣水牛命名，並與東南亞國家進行水牛領域的國際學術交流合作，期能加深研究廣度與產業應用。
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畜試所表示，未來將於花蓮地區培育適應力強的優良水牛品種，並結合原民傳統文化、地方創生、資源整合、加工技術、人才培育、農副產品、食農教育等面向努力，期望能喚起年輕農民對水牛養殖的興趣，為臺灣水牛產業注入新生命！這些努力成果為臺灣水牛產業的永續發展奠定了重要的基礎。
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