日本首都東京受到地震影響，地鐵停駛，有些民眾徒步走路回家，或是在街頭過夜，直到清晨6點，只有部分的鐵路和新幹線陸續通車，至於日本的東北方則是因為受到海嘯重挫，鐵路仍然無法通行。
大地震後，人潮擠滿新宿火車站的南邊出入口，大夥站著或直接席地而坐，因為火車停駛，只好從前一天開始等車回家，有的人都等到睡著，幸好早上6點開始，部分火車通車，可以順利回家。日本電視台記者：「有一個女大學生昨天發生地震時，在神奈川縣面試，到了凌晨3點，才好不容易回到新宿，但因為JR沒通車，直到目前為止還沒辦法回到池袋家。」
雖然已經抵達新宿，不過女大學生回家的路才走到一半，一對77歲的夫婦在街頭等了5個小時的計程車，卻根本沒車可搭，只好再回車站。除了部份火車陸續通車，新幹線也在早上7點之後，部分恢復通車，因為地震災情嚴重，東北新幹線也一時間沒辦法恢復通車，上班族想回家，只能徒步走。日本電視台記者：「只有看得到斑馬線上的人，還可以走來去。」
東京民眾最依賴的地鐵，因為強震停駛，使得車潮大量湧現，大型快速道路變成停車場，市區內同樣擠得水洩不通，有的人乾脆走路步行，車潮、人潮全部幾上街頭，入夜之後整條公路被車塞滿，車燈都快變成路燈，從高空鳥瞰，許多轎車在橋上大排長龍。
東京一間容器工廠，因為強震發生藥品外洩，結果2名堅守工作崗位的員工，卻不幸喪命，雖然平常都有做好地震逃生演練，但這次大地震帶給東京民眾的震撼，卻也久久不能散去。
