香港回歸後，北京在香港設置「中聯辦」，作為國務院派駐單位，但中聯辦常被認為干預太多，也被視為是大陸監控香港的機構，行政院通過兩岸互設辦事處的法律草案，最快明年底，兩岸就可互設「辦事處」，對此，藍綠各有不同解讀，民進黨立委質疑，屆時大陸駐台辦公室，恐怕淪為「中聯辦第二」，也有主權淪喪之虞，但陸委會強調，互設辦事處享有領館及領事人員的豁免權，是兩岸相互承認治權的第一步。
TVBS記者許儷齡：「海基、海協兩會，做為兩岸橋梁行之有年，現在更進一步，兩岸互設分支機構的法源已經出爐，可望明年底前，海協會可來台設置辦事處。」
抗議北京在港設置的中聯辦插手，香港民眾走上街頭，綠營立委質疑，海協會設駐台辦公室，台灣很可能變成第二個中聯辦。
民眾齊聚中聯辦外抗議，就算亮晶晶招牌貼在外頭，徽章擺正中間，五星旗更直接高高掛，被質疑是大陸駐港監控的象徵，綠營質疑，同樣情形搬到台灣，等同被監督，何況辦事處不具換發、補發身分證功能，也不能核發旅行簽證，究竟有沒有設置必要。
民進黨立委蔡煌瑯：「設這辦事處之後，會不會變成大陸的情報蒐集中心，這令我們非常擔心。」
藍營則認為，草案通過為兩岸相互承認治權邁出第一步，雙方的辦事機構，能享有領館和領事官員的豁免權，大陸駐台機構能有館舍，文件不被侵犯保障，館舍也能免稅，領事官員人身不得侵犯，等於互相承認治權。
國民黨立委吳育昇：「方方面面都需要一個正式的辦事處，來爭取、維護我們的權利，跟對岸做必要溝通。」
兩岸互設辦事處，藍綠各自解讀。
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