教育部長吳茂昆上任41天爭議不斷，今（29日）請辭獲准，成為史上最短命教長，甚至傳出他是「被請辭」，而出手的人正是行政院長賴清德。不過，賴揆稍早首度回應稱，指吳2005年赴陸參加研討會，最近才知道有違法疑慮，因此「主動請辭」，而他也贊成吳以同樣標準檢驗自身理念，因此接受辭呈。
據了解，立法院今進行本會期最後1次院會，賴清德傍晚前往立院致意，被媒體問到吳茂昆請辭一事時表示，教育部長上週末透過行政院秘書長卓榮泰向他請辭，而2人今早通過電話後，「我贊成他要以一樣的標準檢驗自己的理念，因此我接受他的辭呈」。
有關吳請辭的原因，賴清德指出，吳茂昆擔任國科會主委期間，於2005年10月向政院請假，前往大陸出席2場學術研討會，參加完在蘇州舉行的第1場國際學術會議後，又應其恩師朱經武教授的邀請，利用週末前往浙江，參加由香港科技大學和浙江大學共同舉辦的國際學術高峰會。
賴清德接著說，吳茂昆是近日才知道，當時參加的2場研討會，其實只有第1場獲得政院批准，恐有違法疑慮，因此他認為身為教育部長，應以同樣、甚至更高的道德標準來檢驗自己，希望藉此停止紛爭，讓教育部的工作能夠順利的推展；至於繼任人選，賴則說會擇日再向社會報告，教長職務將由次長暫代。
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