當特偵組查辦王金平關說案，演變成濫權監聽醜聞，一再信誓旦旦「尊重司法」的馬總統，一步步築起防火牆，和特偵組「劃清界線」，馬總統兩度澄清，關說案是黃世銘主動報告，特偵組監聽檢察官林秀濤一事，自己是事後才知情。當特偵組扯上違法監聽國會，總統更拋下重話，「濫權監聽，就送法辦，決不護短」。
總統馬英九(09.08)：「如果這不是關說，什麼才是關說？立法院長涉入司法關說，妨害司法公正，將是民主政治非常嚴重的恥辱。」
過去馬總統把話說絕，不留一絲轉圜空間，但特偵組靠「監聽」查案，先是挨批白色恐怖捲土重來，更傳出背後有政治考量。高檢署檢察官林秀濤(09.11)：「(黃世銘)甚至語帶威脅，(跟我說)你不准洩密，否則我要辦你洩密罪，可是你轉過頭來，你就立刻去跟總統去洩密了。」
高檢署檢察官砲轟回擊，不認涉嫌關說，讓外界質疑特偵組淪為政治打手，總統卻不再親上火線。記者侯慶莉：「9月14日，關說案爆發的第9天，當時馬總統還強調，黃世銘辦案事前沒有報告，事先不知情，沒有陰謀更，不是政治鬥爭。」
爭議越演越烈，事後才知道，高檢署檢察官林秀濤也被監聽，但消息一出，府方忙澄清，強調黃世銘沒和馬總統報告，撇清知情。記者vs.總統馬英九(09.28)：「總統，立法院被違法監聽。」
敏感問題，馬總統乾脆轉過頭去，但如果特偵組辦案，想監聽誰就監聽誰，整個國會都全面淪陷，當初總統捍衛司法正義的決心哪裡去了？法務部次長陳明堂：「(監聽)引發社會爭議，已經造成對政府信賴的質疑。」
特偵組查關說，扯出案外案，總統拍板定調，司法關說部分，官司照打，黨紀處分不變，至於監聽爭議，交給法務部行政調查，如果檢察總長真的違法監聽，就送法辦。記者侯慶莉：「當司法關說案演變監聽風暴，馬總統強調，違法關說、濫權監聽都不對，誰逾越了司法那條紅線，他都不會袒護。」
政治風暴當前，馬總統選擇隱身。
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