泰勞暴動事件，因為陳菊私下一句「背後應該是有力人士」的說法，引發連串政治效應，根據TVBS獨家消息，陳總統不怪陳菊，但認為整起事件確實已經傷害了政府的形象，而新潮流也由大老邱義仁和洪奇昌出面，約束派系成員不要再火上加油。
泰勞仲介管理引發的爭議，陳總統說了重話，認為這傷了政府形象。總統府秘書長游錫堃：「這樣傳播是不好的，對政府有傷，（總統）他覺得各單位應該在這方面很快速的進行了解，然後對外說明。」
憂心對外影響台灣在國際的形象，對內甚至引發新潮流槓上正義連線的派系鬩牆，陳總統親自定調，希望一切回歸司法。總統府秘書長游錫堃：「我不覺得他對陳菊有不滿，總統最在意的是說，像這樣的事情，不要讓外界有誤會，如果有不法的地方，總統也要求一定要查辦。」
事實上，勞委會主委陳菊26日下午曾和院長謝長廷當面報告，而行政院也澄清，陳菊並沒有提出自請處分或請辭；至於新潮流部份，也在大老邱義仁和洪奇昌親自協調後消音，派系成員不得再以個人身分對外發言，要讓政治效應不要擴大，一切交給檢調司法。
