陳水扁總統拋出國統會和國統綱領的存廢問題，讓行政團隊有些措手不及，經過府院黨接連幾天會商，府院黨確定統一立場，陸委會主委吳釗燮，把廢除國統會的原因，歸咎到立法院大砍國統會預算，並且消毒，強調總統的話根本還不是既定政策。
媒體追問國統會存廢問題，蘇貞昌的態度始終如一。
記者：「院長，國統綱領的事？」行政院長蘇貞昌：「謝謝。」記者：「初二有和總統會面嗎？」
蘇貞昌不願多談，不過其實扁蘇兩人，年初二曾經為此秘密會面，行政部門也曾在年初四進一步密商。
外交部長黃志芳：「只是考慮，又不是馬上，要用台灣名義參與聯合國，美方說如果用『台灣』參與聯合國，是構成對現狀的改變，我想這話 也可能『言重了』，可能美方對台灣參與國際組織，對台灣的困境，可能不太清楚。」
台灣加入聯合國，美國認定是改變台海現狀，外交部只得緊急澄清，只是總統為何要在新春期間拋出震撼彈，陸委會把話說得更明白。
陸委會主委吳釗燮：「2003年的國統會預算，被立法院刪到剩下1千塊，如果說以這個背景來看的話，立法院有關於2003年預算的這個作法，就是實質要廢掉國統會的運作，和四不一沒有是沒有任何關聯的。」
把責任歸諸立法院，再強調不違背總統就職承諾，也不是政府既定政策，政府從上到下，統一說法，力求消除疑慮。
