ETC爭議不斷，其中針對交通部評選遠通為第一名優先廠商，引發被評選為第二名的宇通資訊不滿，提告要求撤銷決議，高等行政法院下午判決，交通部需撤銷遠通的優先權，重新審議評選。而高工局晚間臨時召開記者會，表示要等到收到判決書，才決定是否上訴。
ETC電子收費系統的建置營運案，第二名的宇通公司沒得標，還提出行政訴訟，槓上交通部，高公局兩項敗訴，但委任律師不服。
高公局委任律師：「台北高等行政法院，用違反所謂的原則，所謂的公平原則是非常抽象的，判決裡面如果沒有具體的指出，究竟行政機關有什麼違法之處，這樣的判決是沒有說服力的。」
ETC電子收費BOT案，當初吸引7家廠商競爭，而獲得評選第一名的遠通，卻引發不滿，評選第二名的宇通資訊認為，遠通的資格和條件都不是最好的，甚至認為高公局都沒有提出協商條件，因此提出行政訴訟，高等行政法院判決，宇通勝訴，交通部必須撤銷遠通的優先權，重新評選。
但ETC已經上路，在新的評選結果還沒出爐前，遠通還是得繼續已承接的業務；而高公局也表示，要等收到判決書之後，才決定要不要繼續上訴。
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