台北地院一審宣判，馬英九特別費案無罪，晚間台北地檢署決定上訴；針對法官在判決書內，指控檢方用司法權介入查帳，還有證人吳麗洳，筆錄斷章取義，以及馬英九沒有犯意等五大部分，檢方自認，偵查過程沒有不當，決定一一反駁，提起上訴，而馬英九得知後，則是反應平常，表示這不需要太擔心。
馬英九被判無罪，不但承辦檢察官侯寬仁，開記者會撇清筆錄絕對沒扭曲，北檢也在收到判決書後，立刻提上訴，列出五大理由，希望能扳回一城；首先，針對判決書上指出，檢方利用職權，干涉查帳，檢方提出刑事訴訟法反駁，他們有權發動偵查，法官無權干涉。
而判決書�，法官解釋特別費的用途，也被檢方批評是說法前後矛盾，檢方更否認證人吳麗洳的筆錄，是斷章取義，法官的論點，是個人主觀看法，如果要用來說明，馬英九沒有犯罪意圖，根本沒有說服力。
第五點上訴理由，檢方認為，法官特別引用宋代公使錢，來解釋特別費的歷史沿革，引據失當，因為這2個款項，時空背景不同，怎能替馬英九脫罪 檢方火力全開，馬英九倒是態度從容，一點也不意外。國民黨總統參選人馬英九：「這沒什麼太多需要擔心的，我們好好準備、好好辯論，就是最好的因應方式。」
特別費案一審，馬英九暫時贏回了清白，但二審的司法大戰，是否會展開，悠關2008年總統選戰，更備受矚目。
