前總統陳水扁，聲稱有好幾起機密外交，但總統府查無相關檔案予以註銷，因此特偵組懷疑部份經費，可能被匯到海外帳戶，而特偵組偵辦疑似海外洗錢案，短時間內還難有確實結果，因此傳出特偵組打算將國務機要費案，先偵結起訴。
半個月前，陳水扁二度被特偵組約談，希望他對於國務機要費的資金流向，說清楚，講明白。
因為在馬英九註銷機密文件後，傳出原本陳水扁所謂的3項機密外交，其實一點也不機密，甚至還懷疑有部分經費，已經匯到扁家的海外帳戶。檢察總長陳聰明：「一切案件都還在偵辦中。」
儘管案情有重大突破，卻傳出國務機要費案，陳水扁部分即將在這個月偵查終結，以貪污罪嫌追加起訴；會這麼急著切割，是因為國務機要費和洗錢風暴的金額數字兜不攏，時間上也有落差，再加上請求國外司法互助調查的資料，短時間之內無法湊齊，所以特偵組決定先偵結國務機要費案。
如果審理的結果，發現國務機要費的1480萬是貪污所得，又流向海外，那麼就可以證明扁家境外資金是不法所得，洗錢罪名就能成立。
不過，在國務機要費起訴之前，特偵組要再給陳水扁機會，如果陳水扁無法提出合理說法，或繼續以機密外交來抗辯，恐怕這個月就會被追加起訴。
