辜仲諒偵訊的光碟內容，字字句句全被攤了出來，內容怎麼會全在報紙曝光，由於現在法院已經開放閱卷，可以接觸光碟內容的包括律師、檢察官、法官，誰外漏的引發關注；而陳前總統律師先前也指控，偵訊辜仲諒明明有1個半小時，但筆錄記載卻只有最後半小時，質疑檢方筆錄有落差，特偵組否認，強調當事人都有簽名具結，看過沒有問題，筆錄絕對沒有不實。
陳水扁律師鄭文龍(98.02.06)：「特偵組呈報給法院的光碟，有一些跟實際筆錄記載，有非常大的落差。」
陳水扁律師指控特偵組有問題的筆錄，說的就是前中信金副董事長辜仲諒，2008年11月24日首度返台偵訊的內容，認為其中對陳水扁有利的都沒記載，甚至有些光碟有影無聲，像消音般，出現1個小時的空白，最後檢方更將一個半小時的訊問內容，擷錄出半小時作成筆錄。
對此，特偵組強調，筆錄本來就不是逐字紀錄，但絕對依當事人，也就是辜仲諒的原意記載，最後也讓他簽名確認內容，所以沒有筆錄不實的疑慮，既然筆錄沒問題，那麼紀錄偵訊過程的光碟怎麼會外流？
依照法律程序，檢方起訴後，要把筆錄跟光碟送到院方供閱卷，包括特偵組檢察官、法官、律師和助理，以及北檢的公訴檢察官都能看得到。記者：「所以有可能是他們(律師)透露的？」特偵組發言人陳雲南：「這是可能性之一，是否他們(律師)洩漏我不清楚，但我們檢察官，不可能把筆錄給外界看。」
律師究竟是不是透露案情的深喉嚨，超出特偵組掌握範圍，但可以確定的是，辜仲諒偵訊內容曝光，不但抖出了扁家家務事，也讓檢辯雙方在庭外針鋒相對。
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