海基會董事長辜振甫逝世，兩岸同表哀悼，走過日本統治、國民黨兩蔣與李登輝總統、民進黨陳水扁總統，甚至對岸的前國家主席江澤民，辜振甫都備受禮遇。不過1947年辜振甫因為台獨遭判刑入獄，以及父親辜顯榮在1985年引日軍進入台北城的歷史，始終是辜振甫不願多談的往事。
海基會董事長辜振甫3日凌晨逝世，他在1990年代，兩次在前總統李總統的授權下，先是1993年辜汪會談的兩岸破冰，後是1998年代表前總統李登輝踏上大陸土地的辜汪會晤，兩次都寫下兩岸關係的重要記錄。
不過辜振甫在立法院報告辜汪會談時，他在1947年一度遭到國民黨政府以台獨叛亂罪判刑入獄一事，曾經成為陳水扁質詢的焦點，讓向來溫文的辜振甫，也一度動怒。海基會董事長辜振甫（1993.05.10）：「坐牢過有什麼不名譽，那樣可以叛罪嗎？政府沒有替我平反，我已經很不平了，今天又在立法院有這種（待遇），我覺得非常不公平。」海基會董事長辜振甫(1993.05.10)：「我不敢為自已打分數，不過很勉強的及格。」
1988年的辜汪會晤，再次遭到民進黨立委蘇煥智重提辜顯榮引日軍入台的往事，辜振甫一回台灣，面對媒體的詢問，極度不耐煩的表情，看的出他的憤怒。海基會董事長辜振甫（1998.09.30）：「從來沒有出賣過台灣。」
有關辜顯榮的部份，根據可考的歷史記載，1895年馬關條約簽訂，日軍隨即在6月佔領基隆，消息傳到台北，先前成立的台灣民主國立告瓦解，文武官員逃走一空，台北城陷入混亂，台北士紳大賈為了治安，會商擬好請日軍進城的呈文，辜顯榮當場請纓前往送交，日軍在他的帶路下，順利進入台北城，儘管這是台北士紳的共同決議，不過辜顯榮的歷史功過，至今仍在爭議中。
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