為了蓋高鐵，政府和民間合作BOT案，政府就拿出將近400億元，這些都是納稅人的錢，而高鐵營運到去年底，累積虧損還有640億，票價還經常傳出「即將喊漲」，但高鐵賣給員工的票價，卻是「1折」不到，只要有空位就能搭乘，以北高票價1490元為例，高鐵員工購買只要37元，比搭捷運還便宜，高鐵出面解釋，並不是自肥，是希望員工在休假期間多搭高鐵，順便在車上提供乘客服務，現場剛花近千元買完票的乘客，聽到後也大呼，實在是不公平。
TVBS記者曾翌萍：「台北到高雄搭高鐵的話，票價是1490元，不過高鐵的員工卻只要花37元，被說是比一杯咖啡還要便宜。」
民眾：「孕婦才可以買半票，(票價)等於是他們的10倍，他們30幾元，我們卻是花350。」
民眾大呼不公平，而這是高鐵的解釋。記者：「為什麼高鐵還在虧損600多億的狀況下，會訂出『2.5%』這麼低的優惠？」高鐵經理陶令瑜：「嗯，我這邊還是必須很嚴正的重申，我們沒有把(2.5%)當成是一個員工優惠，員工可以在非值勤的期間，你還必須不要忘記你自己是高鐵員工，你(搭乘時)要去執行你的，不管是協助旅客的任務，或是碰到緊急狀況，你要去做安全的協助。」
員工搭車得帶識別證，高鐵表示，要提高空位使用率，員工上車即使是休假時間，也得提供服務，於是訂出台北到高雄1490元，員工只要付百分之2.5%，也就是37元，能用2.5%買票的員工有2970人，假設用原價買北高票，得付出約443萬，但實際只付37元，算下來高鐵只收了11萬。
民眾：「差太多了，太不公平了。」
其他大眾運輸工具，像是台鐵每年給員工20張半價優惠購票憑證，台北捷運沒有優惠，高雄捷運的員工憑識別證，就可免費搭乘捷運。記者：「現在還要再持續這個(2.5%)的優惠嗎？」陶令瑜：「嗯，因為這是去年9月我們才開始實施，所以相關的後續的整個效應的評估，我們可能自己還要再做檢視。」
高鐵表示，為了平息外界疑慮，員工票價只付2.5%的做法，會再進行檢討。
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