被指控捲入88槍擊案，以及多年前學甲爐渣案的民進黨中執委郭再欽，今（12）日遭台南地檢署起訴，檢方指出，學甲爐渣案地檢署重啟調查，歷時3年多，對明祥馨公司包括郭再欽在內等8名負責人，依違反《廢棄物清理法》、《公司法》、侵占等罪嫌提起公訴。檢方也表示，偵結後，對郭再欽等人的不法所得，聲請保全扣押，經法院裁准，已於12月上旬完成查扣。
檢方起訴書指出，104年8月，檢方認為明明祥馨公司違法在學甲區將軍溪畔的大灣段農地，以及學甲工業區一帶多塊土地，違法填埋電弧爐事業廢棄物爐碴，嘉義地檢署檢察官指揮法務部調查局嘉義縣調查站，對明祥馨公司發動搜索，並至回填的各段檢舉地進行挖掘採驗，移交台南地檢署偵查。
當時因為認為回填的爐渣，是再利用後產品，並非廢棄物，給出處分不起訴，並 還所有扣押證物，後於108年4月間又因當地里長重新檢舉，指稱前案未調查到大灣段農地、學甲工業區一帶，以及某國有地上也有違法填埋爐渣等情事，要求對前案重啟調查。南檢重新偵辦，開挖發現確實有非法回填電弧爐爐渣，並得知後壁案的涉案人賴榮添，也是學甲案的關係人，2案也密切關聯。
但事隔10年，前案證物也都發還給當事人，檢察官2案以原始卷宗為起點，重新比對分析，調閱後壁區爐渣案的的超翔公司、學甲爐渣案的明祥馨公司，2公司98年到104年間相關資料，發現超翔公司98年因88水災，釀成爐渣溢流，後壁區的爐渣篩分場無法繼續營運。
超翔公司負責人賴榮添與魏姓金主，一起找上同樣事業遭遇到瓶頸的明祥馨公司學甲廠，明祥馨的郭再欽同意將爐渣篩分場地，移轉至明祥馨公司廠房，並借用其名義經營，郭再欽發現有利可圖，沒多久也入股賴、魏的爐渣事業，三分期股。
檢方指出，郭再欽明知電弧爐爐碴不能填埋於農地，卻貪圖厚利，由郭再欽利用其擔任學甲農會理事之便，取得大灣段靠將軍溪農地，並以馬姓男子名義登記，提供該土地，再雇用林姓男子用送來自某鋼鐵場之爐渣至農地回填。
檢方估計，違法填埋的爐渣大灣段農地達98,341公噸，學甲工業區達581,629公噸，總計達679,970公噸的鉅量，絕大多數均填埋於郭再欽掌握管領權的土地內。明祥馨公司因違法填埋，節省的「廢棄物清除費」達新台幣18億元以上，從各家鋼鐵廠收取的清除處理費用達3億6千萬餘元。
檢方表示，爐渣案今年10月間偵結後，擬對被告郭再欽等之不法利得聲請保全扣押，經法院駁回要求補件，於11月底重新申請，經法院裁准後，在12月上旬完成查扣被告等財產，之後才公告偵查結果。
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